奧林巴斯顯微鏡:纖維的FISH(熒光原位雜交)

2020-09-04 09:28:23

這個(gè)術(shù)語(yǔ)是指纖維的FISH的普遍做法進(jìn)行準(zhǔn)備延長(zhǎng)染色質(zhì)纖維的熒光原位雜交(FISH)。映射還通過進(jìn)行FISH調(diào)查,在染色體上的DNA片段,在幾百萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)的距離之內(nèi)的信號(hào)彼此由于多方面的結(jié)構(gòu)在中期染色體的DNA鏈?zhǔn)菬o法區(qū)分的。染色體信號(hào)的分辨率提高了,如果之前使用它們進(jìn)步充分冷凝。我們可以做些什么,當(dāng)我們要映射多個(gè)相鄰的DNA克隆嗎?創(chuàng)建地圖規(guī)模的一個(gè)堿基對(duì)整個(gè)基因組DNA序列的特性,將解決這個(gè)問題,但是是非常耗時(shí)的。


fish figure1


人類基因組的計(jì)算包含30,000-100,000基因,也就是說,1,200-4,000平均每條染色體基因。10-15千堿基對(duì)的平均大小排隊(duì)間隔40-45千堿基對(duì)的DNA鏈的基因。需要新的程序,以便產(chǎn)生包含這些基因的DNA片段的詳細(xì)地圖。


以下討論兩種機(jī)制來克服的分辨率限制使用時(shí)遇到的FISH中期染色體。段映射下有一萬(wàn)個(gè)堿基對(duì)(Mbps)的分辨率可通過使用拉伸染色質(zhì)(DNA)纖維。


 

 


映射在一萬(wàn)個(gè)基對(duì)(Mbps)的分辨率 


· FISH上相間核 -可以創(chuàng)建使用間期核染色質(zhì)纖維延伸到細(xì)胞核的高分辨率地圖,因?yàn)樗麄兏煺箷r(shí)相比,在中期染色體(參見圖1)。本程序是可用于映射在分辨率為50-500千堿基對(duì)的DNA克隆,但其準(zhǔn)確性有所減少,因?yàn)槿旧|(zhì)纖維的延伸度各不相同。


· 擴(kuò)展的染色質(zhì)纖維的制備 - FISH檢測(cè)信號(hào),較高的分辨率的方法,得到,通過人為延伸的DNA雜交(圖1)之前,在載玻片上的染色質(zhì)纖維。 

 


纖維的FISH過程 


· 細(xì)胞分散在載玻片上,空氣干燥。


· 洗滌劑(曲拉通X-100)在密閉容器中,在載玻片上的細(xì)胞裂解。


· 染色質(zhì)纖維的高度時(shí),它慢慢地從容器中取出的載玻片。


· 的制備用乙醇固定。


· 上面的距離為5-700千堿基對(duì)的高的分辨率FISH成為可能。


· 探針進(jìn)行雜交后的標(biāo)準(zhǔn)程序。


目前用于纖維的FISH命令了一系列從染色體克隆的DNA片段,并估計(jì)這些克隆之間的距離。然而,仍然必須進(jìn)行檢查DNA鏈的亞微觀層面更多的細(xì)節(jié)。亞顯微測(cè)量的難度使得跟蹤和距離測(cè)量不清楚。目前的研究正在探索潛在的方法可同時(shí)檢測(cè)信號(hào)和DNA鏈。掃描探針顯微鏡是一種很有前途的候選人。